बाबा बागेश्वर ने आखिरकार उस विवाद में एंट्री ले ही ली, जिसकी वजह से देश सीधे सीधे दो गुटों में बंटा हुआ था. पंडित धीरेंद्र शास्त्री ने द केरल स्टोरी के मामले में अब अपनी राय रखी है. उनका मानना है कि ये फिल्म देश के हालात की एक तस्वीर दिखाती है. मगर इस फिल्म को लेकर बाबा की अपनी ही थ्योरी है.