बंगाल के राज्यपाल रहते हुए जनदीप धनखड़ और सीएम ममता बनर्जी के बीच की दूरियां तो जगजाहिर रहीं. दोनों के बीच कभी भी किसी मुद्दे पर एक राय नहीं हो सकी. ममता के हर फैसले पर जगदीप धनखड़ ने सवाल उठाए थे और बंगाल में हिंसा के लिए वो लगातार सरकार पर आक्रामक रहे, उन्होंने कई बार ममता सरकार को फटकार लगाई थी, लेकिन जब उन्होंने उपराष्ट्रपति पद का चुनाव लड़ा तो ममता ने उनके खिलाफ जाने की बजाय चुनाव प्रक्रिया से किनारा करना ही ठीक समझा. ये सवाल उस वक्त भी हर किसी के मन में आया था. लेकिन दोनों के बीच इसी तल्खी को लेकर अब राजस्थान के सीएम अशोक गहलोत ने चुटकी जरूर ली है.