Jawa 42 FJ में कंपनी ने334 सीसी की क्षमता का लिक्विड-कूल्ड सिंगल सिलिंडर इंजन इस्तेमाल किया गया है. रेगुलर जावा 42 के मुकाबले ये इंजन तकरीबन 2hp ज्यादा पावर जेनरेट करता है. इस बाइक में कुछ मॉर्डन फीचर्स को भी शामिल किया गया है.