हैदराबाद धमाकों के बाद जैसे जैसे जांच आगे बढ़ रही है वैसे-वैसे इंडियन मुजाहिद्दीन की ओर शक पुख्ता होता जा रहा है. चाहे बम बनाने का तरीका हो या फिर उन्हें प्लांट करने का, उंगलियां इंडियन मुजाहिद्दीन की ओर उठ रही हैं. कई और ऐसे सबूत और सुराग जांच एजेंसियों को मिले हैं जिसके आधार पर ये तय माना जा रहा है कि धमाकों में हाथ इंडियन मुजाहिद्दीन का ही है.