भारतीय खुफिया एजेंसी रॉ के पूर्व प्रमुख ने वाजपेयी सरकार और फारूक अब्दुल्ला पर गंभीर आरोप लगाए हैं. उनका दावा है कि 1999 में एयर इंडिया की फ्लाइड IC 814 की हाइजैकिंग मामले में वाजपेयी सरकार से भारी चूक हुई थी.