मालेगांव विस्फोट के चार महीने बाद एटीएस ने अदालत में चार्जशीट पेश की. चार्जशीट में सेना के अधिकारी लेफ्टिनेंट कर्नल पुरोहित को मुख्य साजिशकर्ता और साध्वी प्रज्ञा सिंह ठाकुर को प्रमुख आरोपी बताया गया है.