वक्फ बोर्ड को लेकर आरोप हैं कि बोर्ड हाल के दिनों में भू-माफिया की तरह व्यवहार कर रहा है, जिसमें निजी से लेकर सरकारी भूमि, और मंदिर से लेकर गुरुद्वारे तक की संपत्ति पर कब्जा किया जा रहा है. डिफेंस और भारतीय रेलवे के बाद, वक्फ बोर्ड देश में तीसरा सबसे बड़ा भूस्वामी है.